电磁屏蔽室的组成系统有五大系统组成，分别是电源系统，消防报警系统，空调系统，接地系统，进排风系统组成。

空调系统：屏蔽室空气调节系统可根据实际情况配置。有中央空调时可由波导窗直接接入，也可单独安装空调。民用空调、商用空调、精密空调均可选用，空调电源线、内外机控制信号线、气水管都必须进行相应屏蔽处理。

消防报警系统：电磁屏蔽室应配备消防报警和喷淋系统。报警信号线及相关控制信号也要分别进行滤波处理。一般配置烟感报警信号一路。

接地系统：因工作时壳体有一定漏电（与滤波器工作特性有关），故防护室接地要求极高。要求单点接地，跟地质因素有关，接地电阻≤1Ω。

电源系统：屏蔽室电源一般按需要配置设备电源、空调照明辅助电源。因工作时壳体有一定漏电，故防护室电源不能经过漏电保护器。

隔震：人防、国防指挥所工程的通信要素室都涉及隔震工程，与电磁脉冲防护室有密切的交叉施工关系。隔震分标准隔震和简易隔震，前者工艺复杂，造价较高，简易隔震由黄沙层、混凝土层组成。

进排风管：电磁脉冲防护室要与进排风管衔接，应在其铺设到位后才能进场安装。